中科院上海药物所中山研究院夏国钦课题组招

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课题组长简介

夏国钦,中国科学院上海药物研究所、中国科学院药物创新研究院中山研究院研究员、课题组长。年本科毕业于武汉大学,年博士毕业于中科院上海有机化学研究所。博士期间师从陆熙炎院士,主要从事二价钯催化的串联环化反应研究。年10月至年3月在美国Scripps研究所Jin-QuanYu教授课题组开展第一站博士后研究,主要研究方向为位点选择性和空间选择性的sp3C-H键活化反应。年3月至年10月,在化学生物学先驱之一的StuartL.Schreiber教授课题组从事第二站博士后研究,主要方向为DNA编码化合物库(DEL)的合成与筛选。年10月至年4月,在Scripps研究所BenjaminF.Cravatt课题组担任StaffScientist,主要从事基于活性的蛋白质组学研究。迄今为止以第一作者或参与作者在Nature,Nat.Chem.,J.Am.Chem.Soc.,Angew.Chem.Int.Ed.等国际顶级杂志上发表学术论文9篇。

研究方向

1.非共价结合导向的、生物兼容的选择性化学新转化的发展,尤其是针对蛋白质上广泛存在的羧基、羟基、氨基、巯基等官能团的高效成键反应的开发。

2.多元杂环类化合物的不对称模块化构建方法,并对积累的化合物库进行化学蛋白组学筛选,寻找新的致病靶点和活性化合物。

3.针对K-Ras各类变异蛋白等“难成药”靶点的共价抑制剂的开发。

招聘岗位

(一)博士后3-4人

岗位要求

1.有机化学或者药物化学方向博士后:研究生期间从事有机合成或者药物化学方面的研究,以第一作者已经或即将发表SCI论文,能够独立开展科研工作。原则上年龄不超过35周岁,工作积极主动,严谨踏实,责任心强,具有良好的团队合作精神。

2.化学生物学方向博士后:研究生期间从事化学生物学方面的研究,以第一作者已经或即将发表SCI论文,能够独立开展科研工作。原则上年龄不超过35周岁,工作积极主动,严谨踏实,责任心强,具有良好的团队合作精神。具有细胞表型筛选和化学蛋白组学筛选经验者优先。

博士后待遇

税前工资36万/年(含基本工资、绩效工资及政府补贴部分),另可申请政府科研经费10万元;享有五险一金,交通补贴,餐补,年度健康体检等单位福利,及享受子女入学优惠政策(可任意选择就读中山市九年义务公办学校);博士后出站后留在中山翠亨新区工作者,可享受政府住房补贴50万元(分三年支付);支持参加各种国际、国内会议,鼓励申请各类博士后人才计划。工作特别优秀者可申请参评中国科学院上海药物所副研究员。

(二)研究助理:3人

岗位要求

1.硕士学历2人:有机化学或者药物化学专业,有一定的有机化学合成经验。工作认真负责、严谨勤奋,具有良好的团队合作精神。

薪酬待遇:~/月

2.本科学历1人:专业不限,负责协助课题组长实验室日常管理(仪器设备、药品等采购,财务报账等。)

薪酬待遇:~/月

注:以上薪酬待遇是大体框架,具体细节可以面议。

*博士后招聘长期有效。

工作地点:广东省中山市。

应聘方式

请将个人简历和研究总结发送到邮箱xiaguoqin

simm.ac.cn,条件符合者将尽快安排面试。

参考文献

1.Xia,G.;Zhuang,Z.;Liu,L.;Schreiber,S.L.;Melillo,B.;Yu,J.-Q.“Ligandenabledβ-methyleneC(sp3)-Harylationofmaskedaliphaticalcohols.”Angew.Chem.Int.Ed.,,59,.

2.Herron,A.;Liu,D.;Xia,G.;Yu,J.-Q.“δ-C–Hmono-anddi-halogenationofalcohols”J.Am.Chem.Soc.,,,.

3.Xia,G.;Weng,J.;Liu,L.;Verma,P.;Li,Z.;Yu,J.-Q.“Reversingconventionalsite-selectivityinC(sp3)-Hbondactivation.”NatureChemistry,,11,.

4.Wang,P.;Verma,P.;Xia,G.;Shi,J.;Qiao,J.X.;Tao,S.;Cheng,P.T.W.;Poss,M.A.;Farmer,M.E.;Yeung,K.-S.;Yu,J.-Q.“Ligand-acceleratednon-directedC?Hfunctionalizationofarenes.”Nature,,,.

5.Jain,P.;Verma,P.;Xia,G.;Yu,J.-Q.“Enantioselectiveamineα-functionalizationviapalladium-catalysedC–Harylationofthioamitdes.”NatureChemistry,,9,.

6.Shen,K.;Han,X.;Xia,G.;Lu,X.“CationicPd(II)-CatalyzedCyclizationofN-Tosyl-anilineTetheredAlkynylKetonesInitiatedbyHydropalladationofAlkynes:AFacileWayto1,2-Dihydroor1,2,3,4-TetrahydroquinolineDerivatives.”Org.Chem.Front.,,2,.

7.Xia,G.;Han,X.;Lu,X.“EfficientSynthesisofHeterocyle-Fusedβ-NaphthylaminesviaIntramolecularAdditiontoaCyanoGroupInitiatedbyNucleopalladationofAlkynes.”Org.Lett.,,16,.

8.Xia,G.;Han,X.;Lu,X.“Pd(II)-CatalyzedOne-StepConstructionofCycloalkane-FusedIndolesandItsApplicationinFormalSynthesisof(±)-Aspidospermidine.”Org.Lett.,,16,.

9.Xia,G.;Han,X.;Lu,X.“Palladium(II)-CatalyzedTandemCyclizationof2-(Alk-2’-ynyloxy)benzonitrilesor2-(Alk-2’-ynylamino)-benzonitriles:AFacileWayto2H-Chromeneand1,2-DihydroquinolineDerivatives.”Adv.Synth.Catal.,,,.

*本课题组成立伊始,欢迎各个层次对有机化学、药物化学及化学生物学感兴趣的青年才俊积极加盟!

*我们也非常欢迎有意于来本课题组联合培养的全国各高校的硕士和博士研究生积极与我们联系,我们将提供额外的生活补助。

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服务内容之“项目代算”

1.量子化学从头计算

简介:

量子化学从头计算可以提供化合物电子结构信息,分析反应路径,预测化合物光谱和各种性质,量子化学从头计算软件可在不同型号的大型计算机,超级计算机,工作站和个人计算机上运行。与分子显示软件连用可以提供精美的分子结构和分子轨道图片。

主要功能:

化合物稳态结构的确定,如中性分子、自由基、阴、阳离子等;热力学分析,如熵变、焓变、吉布斯自由能变、键能分析及原子化能等;计算化学反应过程,如稳态及过渡态结构确定、反应热、反应能垒、反应机理及反应动力学等;计算并分析分子轨道;计算原子电荷、电势、偶极矩;振动频率分析及计算各大光谱,如IR,Raman,NMR,UV/Vis,VCD,ROA,ECD,ORD,XPS,EPR,Franck-Condon及超精细光谱等;计算极化率和超极化率;计算激发态结构及相关性质,如激发态结构确定、激发能、跃迁偶极矩、荧光光谱、磷光光谱、势能面交叉研究等;计算周期体系的能量,结构和分子轨道;计算分子间相互作用,如氢键及范德华作用。

2.材料化学模拟

简介:

针对材料科学领域研究者的科研需求,可以开展材料的电子结构计算、第一性原理计算、分子动力学模拟、建立分子的三维模型。以可视化方式对各种晶体、无定型以及高分子材料的性质及相关过程进行深入的研究。

主要功能:

搭建各种高分子、无定型聚合物、晶体以及界面模型,对小分子、高分子、晶体以及无定型聚合物等进行结构优化,得到合理的3D分子模型,键能、键长、键角以及相应的振动模式,HOMO和LUMO轨道,红外谱图和拉曼谱图等;计算多个物质间(小分子间、无定型聚合物间、界面间等)的相互作用能、结合能,包括分子间相互作用(氢键、静电相互作用等),化学键相互作用(共价键、配位键、离子键等)。对体系进行分子动力学模拟,体系平衡后,对体系中的物质进行RDF(径向分布函数)分析,MSD(均方根位移)分析,键长、键角以及末端距等结构变化分析等。分析化学反应过程,搜索反应的过渡态,从化学反应的热力学和动力学角度去判断化学反应的过程、反应的难易程度等;计算化学反应的势能变化(△E),焓变(△H),自由能变化(△G)等。模拟不同压力和温度等条件下,吸附剂骨架对吸附质分子的吸附过程,得到饱和吸附量、吸附的最佳位点、吸附能、吸附热等,判断骨架与分子的吸附形式(物理吸附与化学吸附);

X射线衍射分析。

3.第一性原理计算

简介:

第一性原理计算是目前材料模拟和计算物质科学研究中最流行的方法之一。针对周期性或非周期性材料,开展第一性原理计算,获得材料的电子结构信息,对材料性质开展预测。

主要功能:

采用周期性边界条件(或超原胞模型)处理原子、分子、团簇、纳米线(或管)、薄膜、晶体、准晶和无定性材料,以及表面体系和固体;计算材料的结构参数(键长,键角,晶格常数,原子位置等)和构型;计算材料的状态方程和力学性质(体弹性模量和弹性常数);计算材料的电子结构(能级、电荷密度分布、能带、电子态密度和ELF);计算材料的光学性质;计算材料的磁学性质;计算材料的晶格动力学性质(声子谱等);表面体系的模拟(重构、表面态和STM模拟);从头分子动力学模拟;计算材料的激发态(GW准粒子修正)。

4.Gromacs

简介:

用于研究生物分子体系的分子动力学程序包。它可以用分子动力学、随机动力学或者路径积分方法模拟溶液或晶体中的任意分子,进行分子能量的最小化,分析构象等。它的模拟程序包包含GROMACS力场(蛋白质、核苷酸、糖等),研究的范围可以包括玻璃和液晶、到聚合物、晶体和生物分子溶液。GROMACS是一个功能强大的分子动力学的模拟软件,其在模拟大量分子系统的牛顿运动方面具有极大的优势。

主要功能:

计算结构和自由能;轨迹分析和均方位移;计算粘度;计算键长、键角、二面角;二面角主成分分析;氢键分析。

5.Lammps

简介:

主要用于分子动力学相关的一些计算和模拟工作,可以模拟液体中的粒子,固体和汽体的系综。也可以采用不同的力场和边界条件来模拟全原子,聚合物,生物,金属,粒状和粗料化体系。LAMMPS可以计算的体系小至几个粒子,大到上百万甚至是上亿个粒子。

主要功能:

计算结构和自由能;轨迹分析和均方位移;计算粘度;计算键长、键角、二面角;二面角主成分分析;氢键分析。

6.Amber

简介:

Amber是一个多个程序的集合包,大约包含50多个程序,相互协调工作,包含代码和演示的分子模拟软件包,由AmberTools和Amber组成,在多糖、核酸、蛋白质、质膜的模拟中有广泛应用。

主要功能:

计算结构和自由能;轨迹分析和均方位移;RMSD分析;RMSF分析;Cα角的分析;计算键长、键角、二面角;二面角主成分分析;氢键分析。

7.Autodock

简介:

Autodock是一款开源的分子对接软件,最主要应用于执行配体—蛋白分子对接,可以用于构建药物-靶标复合物结构、开展虚拟筛选研究。

主要功能:

刚性对接、半柔性对接、X-射线晶体学;基于结构的药物设计;先导化合物优化;虚拟筛选;组合库设计;蛋白—蛋白对接;化学机制研究。

8.有元限模拟计算

简介:

应用有限元模拟软件,在化学、力学、电磁场、流体、传热、化工、MEMS、声学等领域开展模拟分析,描述电化学过程、材料的力学性能、物质、能量动量的输运等。

主要功能:

电磁学;结构力学、声学;流体流动、传热;化工;多功能;接口产品。

9.XRD单晶数据解析

简介:

使用olex2软件解析单晶数据,可得到晶体结构及相应的晶体参数,并提供相应的二维图像

主要功能:

晶体的晶胞参数和结构的确立;物相鉴定,定量分析物相;测残余应力、晶粒尺寸、结晶度和织构分析;测原子径向分布函数;健长、健角、原子的占位情况与占有率等。

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